Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms