Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRUQ92729 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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PTPRUQ92729 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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PTPRUQ92729 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
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