Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms