Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms