Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms