Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms