Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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TMCO5AQ8N6Q1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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TMCO5AQ8N6Q1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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TMCO5AQ8N6Q1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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TMCO5AQ8N6Q1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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