Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF1Q8N6C5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms