Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms