Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms