Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms