Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RTL6Q6ICC9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RTL6Q6ICC9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RTL6Q6ICC9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RTL6Q6ICC9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RTL6Q6ICC9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RTL6Q6ICC9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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