Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms