Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms