Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms