Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM16LQ309B1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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