Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms