Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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