Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SYT16Q17RD7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SYT16Q17RD7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SYT16Q17RD7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYT16Q17RD7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms