Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IMPG1Q17R60 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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