Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms