Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITSN1Q15811 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms