Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms