Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms