Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms