Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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