Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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