Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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