Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE7AQ13946 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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