Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOFQ13790 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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APOFQ13790 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOFQ13790 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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APOFQ13790 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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APOFQ13790 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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APOFQ13790 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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