Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCOA4Q13772 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms