Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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