Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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