Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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