Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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CNTN1Q12860 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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CNTN1Q12860 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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CNTN1Q12860 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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