Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDR1Q08345 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDR1Q08345 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DDR1Q08345 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms