Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms