Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms