Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms