Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX1P83916 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX1P83916 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX1P83916 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX1P83916 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms