Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB1P82279 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB1P82279 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRB1P82279 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB1P82279 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms