Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms