Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms