Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms