Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MANFP55145 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MANFP55145 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MANFP55145 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MANFP55145 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms