Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOSBP53539 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOSBP53539 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOSBP53539 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOSBP53539 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOSBP53539 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOSBP53539 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms