Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPAP49450 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPAP49450 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms