Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms