Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms