Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP1P29466 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP1P29466 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP1P29466 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP1P29466 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms